Despre existenţa unui dosar penal în care figurează Veaceslav Negruţa Procuratura Generală a anunţat în februarie 2013. În acest caz, oficialul era bănuit de procurori că ar fi încălcat legea atunci când a semnat decizia ca Ministerul Finanţelor să achite fostului director al Asociației Parlamentul '90, Pantelei Sandulachi, un prejudiciu moral în valoare de 400 000 euro. 

Dosarul a fost trimis în judecată în iulie 2013. La mijlocul lunii august acelaşi an, Negruţa şi-a dat demisia din funcţia de ministru al Finanţelor.  

Pe marginea acestui subiect, Veaceslav Negruţa a declarat întotdeauna că este nevinovat şi că la mijloc ar fi o luptă politică.  

Decizia de astăzi a Judecătoriei Rîșcani poate fi contestată la Curtea de Apel.